Tham khảo RNA

  1. ↑ “RNA: The Versatile Molecule”. University of Utah. 2015. 
  2. ↑ “Nucleotides and Nucleic Acids” (PDF). University of California, Los Angeles. 
  3. ↑ Shukla RN (30 tháng 6 năm 2014). Analysis of Chromosomes. ISBN 9789384568177. 
  4. 1 2 3 Berg JM, Tymoczko JL, Stryer L (2002). Biochemistry (ấn bản 5). WH Freeman and Company. tr. 118–19, 781–808. ISBN 0-7167-4684-0. OCLC 179705944. 
  5. ↑ Tinoco I & Bustamante C (tháng 10 năm 1999). “How RNA folds”. Journal of Molecular Biology 293 (2): 271–81. PMID 10550208. doi:10.1006/jmbi.1999.3001. 
  6. ↑ Higgs PG (tháng 8 năm 2000). “RNA secondary structure: physical and computational aspects”. Quarterly Reviews of Biophysics 33 (3): 199–253. PMID 11191843. doi:10.1017/S0033583500003620. 
  7. 1 2 Nissen P và đồng nghiệp (tháng 8 năm 2000). “The structural basis of ribosome activity in peptide bond synthesis”. Science 289 (5481): 920–30. Bibcode:2000Sci...289..920N. PMID 10937990. doi:10.1126/science.289.5481.920. 
  8. 1 2 Lee JC, Gutell RR (tháng 12 năm 2004). “Diversity of base-pair conformations and their occurrence in rRNA structure and RNA structural motifs”. Journal of Molecular Biology 344 (5): 1225–49. PMID 15561141. doi:10.1016/j.jmb.2004.09.072. 
  9. ↑ Barciszewski J, Frederic B, Clark C (1999). RNA biochemistry and biotechnology. Springer. tr. 73–87. ISBN 0-7923-5862-7. OCLC 52403776. 
  10. ↑ Salazar M và đồng nghiệp (tháng 4 năm 1993). “The DNA strand in DNA.RNA hybrid duplexes is neither B-form nor A-form in solution”. Biochemistry 32 (16): 4207–15. PMID 7682844. doi:10.1021/bi00067a007. 
  11. ↑ Sedova A, Banavali NK (tháng 10 năm 2015). “RNA approaches the B-form in stacked single strand dinucleotide contexts”. Biopolymers 105 (2): 65–82. PMID 26443416. doi:10.1002/bip.22750. 
  12. ↑ Hermann T, Patel DJ (tháng 3 năm 2000). “RNA bulges as architectural and recognition motifs”. Structure 8 (3): R47–54. PMID 10745015. doi:10.1016/S0969-2126(00)00110-6. 
  13. ↑ Mikkola S và đồng nghiệp (1999). “The mechanism of the metal ion promoted cleavage of RNA phosphodiester bonds involves a general acid catalysis by the metal aquo ion on the departure of the leaving group”. Perkin transactions 2 (8): 1619–26. doi:10.1039/a903691a. 
  14. ↑ Jankowski JA, Polak JM (1996). Clinical gene analysis and manipulation: Tools, techniques and troubleshooting. Cambridge University Press. tr. 14. ISBN 0-521-47896-0. OCLC 33838261. 
  15. ↑ Yu Q, Morrow CD (tháng 5 năm 2001). “Identification of critical elements in the tRNA acceptor stem and T(Psi)C loop necessary for human immunodeficiency virus type 1 infectivity”. Journal of Virology 75 (10): 4902–6. PMC 114245. PMID 11312362. doi:10.1128/JVI.75.10.4902-4906.2001. 
  16. ↑ Elliott MS, Trewyn RW (tháng 2 năm 1984). “Inosine biosynthesis in transfer RNA by an enzymatic insertion of hypoxanthine”. The Journal of Biological Chemistry 259 (4): 2407–10. PMID 6365911. 
  17. ↑ Cantara WA và đồng nghiệp (tháng 1 năm 2011). “The RNA Modification Database, RNAMDB: 2011 update”. Nucleic Acids Research 39 (Database issue): D195–201. PMC 3013656. PMID 21071406. doi:10.1093/nar/gkq1028. 
  18. ↑ Söll D, RajBhandary U (1995). TRNA: Structure, biosynthesis, and function. ASM Press. tr. 165. ISBN 1-55581-073-X. OCLC 183036381. 
  19. ↑ Kiss T (tháng 7 năm 2001). “Small nucleolar RNA-guided post-transcriptional modification of cellular RNAs”. The EMBO Journal 20 (14): 3617–22. PMC 125535. PMID 11447102. doi:10.1093/emboj/20.14.3617. 
  20. ↑ King TH và đồng nghiệp (tháng 2 năm 2003). “Ribosome structure and activity are altered in cells lacking snoRNPs that form pseudouridines in the peptidyl transferase center”. Molecular Cell 11 (2): 425–35. PMID 12620230. doi:10.1016/S1097-2765(03)00040-6. 
  21. ↑ Mathews DH và đồng nghiệp (tháng 5 năm 2004). “Incorporating chemical modification constraints into a dynamic programming algorithm for prediction of RNA secondary structure”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 101 (19): 7287–92. Bibcode:2004PNAS..101.7287M. PMC 409911. PMID 15123812. doi:10.1073/pnas.0401799101. 
  22. ↑ Tan ZJ, Chen SJ (tháng 7 năm 2008). “Salt dependence of nucleic acid hairpin stability”. Biophysical Journal 95 (2): 738–52. Bibcode:2008BpJ....95..738T. PMC 2440479. PMID 18424500. doi:10.1529/biophysj.108.131524. 
  23. ↑ Vater A, Klussmann S (tháng 1 năm 2015). “Turning mirror-image oligonucleotides into drugs: the evolution of Spiegelmer(®) therapeutics”. Drug Discovery Today 20 (1): 147–55. PMID 25236655. doi:10.1016/j.drudis.2014.09.004. 
  24. ↑ Nudler E, Gottesman ME (tháng 8 năm 2002). “Transcription termination and anti-termination in E. coli”. Genes to Cells 7 (8): 755–68. PMID 12167155. doi:10.1046/j.1365-2443.2002.00563.x. 
  25. ↑ Hansen JL và đồng nghiệp (tháng 8 năm 1997). “Structure of the RNA-dependent RNA polymerase of poliovirus”. Structure 5 (8): 1109–22. PMID 9309225. doi:10.1016/S0969-2126(97)00261-X. 
  26. ↑ Ahlquist P (tháng 5 năm 2002). “RNA-dependent RNA polymerases, viruses, and RNA silencing”. Science 296 (5571): 1270–3. Bibcode:2002Sci...296.1270A. PMID 12016304. doi:10.1126/science.1069132. 
  27. 1 2 3 Cooper GC, Hausman RE (2004). The Cell: A Molecular Approach (ấn bản 3). Sinauer. tr. 261–76, 297, 339–44. ISBN 0-87893-214-3. OCLC 174924833. 
  28. ↑ Mattick JS, Gagen MJ (tháng 9 năm 2001). “The evolution of controlled multitasked gene networks: the role of introns and other noncoding RNAs in the development of complex organisms”. Molecular Biology and Evolution 18 (9): 1611–30. PMID 11504843. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a003951. 
  29. ↑ Mattick JS (tháng 11 năm 2001). “Non-coding RNAs: the architects of eukaryotic complexity”. EMBO Reports 2 (11): 986–91. PMC 1084129. PMID 11713189. doi:10.1093/embo-reports/kve230. 
  30. ↑ Mattick JS (tháng 10 năm 2003). “Challenging the dogma: the hidden layer of non-protein-coding RNAs in complex organisms” (PDF). BioEssays 25 (10): 930–9. PMID 14505360. doi:10.1002/bies.10332. Bản gốc lưu trữ ngày 6 tháng 3 năm 2009. 
  31. ↑ Mattick JS (tháng 10 năm 2004). “The hidden genetic program of complex organisms”. Scientific American 291 (4): 60–7. PMID 15487671. doi:10.1038/scientificamerican1004-60. 
  32. 1 2 3 Wirta W (2006). Mining the transcriptome – methods and applications. Stockholm: School of Biotechnology, Royal Institute of Technology. ISBN 91-7178-436-5. OCLC 185406288. 
  33. ↑ Rossi JJ (tháng 7 năm 2004). “Ribozyme diagnostics comes of age”. Chemistry & Biology 11 (7): 894–5. PMID 15271347. doi:10.1016/j.chembiol.2004.07.002. 
  34. ↑ Storz G (tháng 5 năm 2002). “An expanding universe of noncoding RNAs”. Science 296 (5571): 1260–3. Bibcode:2002Sci...296.1260S. PMID 12016301. doi:10.1126/science.1072249. 
  35. ↑ Fatica A, Bozzoni I (tháng 1 năm 2014). “Long non-coding RNAs: new players in cell differentiation and development”. Nature Reviews. Genetics 15 (1): 7–21. PMID 24296535. doi:10.1038/nrg3606. 
  36. ↑ Chen Q, Yan và đồng nghiệp (tháng 1 năm 2016). “Sperm tsRNAs contribute to intergenerational inheritance of an acquired metabolic disorder”. Science 351 (6271): 397–400. Bibcode:2016Sci...351..397C. PMID 26721680. doi:10.1126/science.aad7977.  Bảo trì CS1: display-authors (link)
  37. ↑ Wei H, Zhou và đồng nghiệp (2013). “Profiling and identification of small rDNA-derived RNAs and their potential biological functions”. PLOS One 8 (2): e56842. Bibcode:2013PLoSO...856842W. PMC 3572043. PMID 23418607. doi:10.1371/journal.pone.0056842. 
  38. ↑ Gueneau de Novoa P, Williams KP (tháng 1 năm 2004). “The tmRNA website: reductive evolution of tmRNA in plastids and other endosymbionts”. Nucleic Acids Research 32 (Database issue): D104–8. PMC 308836. PMID 14681369. doi:10.1093/nar/gkh102. 
  39. ↑ Carthew RW, Sontheimer EJ (tháng 2 năm 2009). “Origins and Mechanisms of miRNAs and siRNAs”. Cell 136 (4): 642–55. PMC 2675692. PMID 19239886. doi:10.1016/j.cell.2009.01.035. 
  40. ↑ Liang KH, Yeh CT (tháng 5 năm 2013). “A gene expression restriction network mediated by sense and antisense Alu sequences located on protein-coding messenger RNAs”. BMC Genomics 14: 325. PMC 3655826. PMID 23663499. doi:10.1186/1471-2164-14-325. 
  41. ↑ Wu L, Belasco JG (tháng 1 năm 2008). “Let me count the ways: mechanisms of gene regulation by miRNAs and siRNAs”. Molecular Cell 29 (1): 1–7. PMID 18206964. doi:10.1016/j.molcel.2007.12.010. 
  42. ↑ Matzke MA, Matzke AJ (tháng 5 năm 2004). “Planting the seeds of a new paradigm”. PLoS Biology 2 (5): E133. PMC 406394. PMID 15138502. doi:10.1371/journal.pbio.0020133. 
  43. ↑ Vazquez F và đồng nghiệp (tháng 10 năm 2004). “Endogenous trans-acting siRNAs regulate the accumulation of Arabidopsis mRNAs”. Molecular Cell 16 (1): 69–79. PMID 15469823. doi:10.1016/j.molcel.2004.09.028. 
  44. ↑ Watanabe T và đồng nghiệp (tháng 5 năm 2008). “Endogenous siRNAs from naturally formed dsRNAs regulate transcripts in mouse oocytes”. Nature 453 (7194): 539–43. Bibcode:2008Natur.453..539W. PMID 18404146. doi:10.1038/nature06908.  Bảo trì CS1: display-authors (link)
  45. ↑ Sontheimer EJ, Carthew RW (tháng 7 năm 2005). “Silence from within: endogenous siRNAs and miRNAs”. Cell 122 (1): 9–12. PMID 16009127. doi:10.1016/j.cell.2005.06.030. 
  46. ↑ Doran G (2007). “RNAi – Is one suffix sufficient?”. Journal of RNAi and Gene Silencing 3 (1): 217–19. Bản gốc lưu trữ ngày 16 tháng 7 năm 2007. 
  47. ↑ Pushparaj PN và đồng nghiệp (tháng 1 năm 2008). “RNAi and RNAa--the yin and yang of RNAome”. Bioinformation 2 (6): 235–7. PMC 2258431. PMID 18317570. doi:10.6026/97320630002235. 
  48. ↑ Horwich MD và đồng nghiệp (tháng 7 năm 2007). “The Drosophila RNA methyltransferase, DmHen1, modifies germline piRNAs and single-stranded siRNAs in RISC”. Current Biology 17 (14): 1265–72. PMID 17604629. doi:10.1016/j.cub.2007.06.030. 
  49. ↑ Girard A và đồng nghiệp (tháng 7 năm 2006). “A germline-specific class of small RNAs binds mammalian Piwi proteins”. Nature 442 (7099): 199–202. Bibcode:2006Natur.442..199G. PMID 16751776. doi:10.1038/nature04917. 
  50. ↑ Horvath P, Barrangou R (tháng 1 năm 2010). “CRISPR/Cas, the immune system of bacteria and archaea”. Science 327 (5962): 167–70. Bibcode:2010Sci...327..167H. PMID 20056882. doi:10.1126/science.1179555. 
  51. ↑ Wagner EG, Altuvia S, Romby P (2002). “Antisense RNAs in bacteria and their genetic elements”. Advances in Genetics. Advances in Genetics 46: 361–98. ISBN 9780120176465. PMID 11931231. doi:10.1016/S0065-2660(02)46013-0. 
  52. ↑ Gilbert SF (2003). Developmental Biology (ấn bản 7). Sinauer. tr. 101–3. ISBN 0-87893-258-5. OCLC 154656422. 
  53. ↑ Amaral PP, Mattick JS (tháng 8 năm 2008). “Noncoding RNA in development”. Mammalian Genome 19 (7–8): 454–92. PMID 18839252. doi:10.1007/s00335-008-9136-7. 
  54. ↑ Heard E và đồng nghiệp (tháng 6 năm 1999). “Human XIST yeast artificial chromosome transgenes show partial X inactivation center function in mouse embryonic stem cells”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 96 (12): 6841–6. Bibcode:1999PNAS...96.6841H. PMC 22003. PMID 10359800. doi:10.1073/pnas.96.12.6841. 
  55. ↑ Batey RT (tháng 6 năm 2006). “Structures of regulatory elements in mRNAs”. Current Opinion in Structural Biology 16 (3): 299–306. PMID 16707260. doi:10.1016/j.sbi.2006.05.001. 
  56. ↑ Scotto L, Assoian RK (tháng 6 năm 1993). “A GC-rich domain with bifunctional effects on mRNA and protein levels: implications for control of transforming growth factor beta 1 expression”. Molecular and Cellular Biology 13 (6): 3588–97. PMC 359828. PMID 8497272. 
  57. ↑ Steitz TA, Steitz JA (tháng 7 năm 1993). “A general two-metal-ion mechanism for catalytic RNA”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 90 (14): 6498–502. Bibcode:1993PNAS...90.6498S. PMC 46959. PMID 8341661. doi:10.1073/pnas.90.14.6498. 
  58. ↑ Xie J và đồng nghiệp (tháng 1 năm 2007). “Sno/scaRNAbase: a curated database for small nucleolar RNAs and cajal body-specific RNAs”. Nucleic Acids Research 35 (Database issue): D183–7. PMC 1669756. PMID 17099227. doi:10.1093/nar/gkl873. 
  59. ↑ Omer AD và đồng nghiệp (tháng 5 năm 2003). “RNA-modifying machines in archaea”. Molecular Microbiology 48 (3): 617–29. PMID 12694609. doi:10.1046/j.1365-2958.2003.03483.x. 
  60. ↑ Cavaillé J và đồng nghiệp (tháng 10 năm 1996). “Targeted ribose methylation of RNA in vivo directed by tailored antisense RNA guides”. Nature 383 (6602): 732–5. Bibcode:1996Natur.383..732C. PMID 8878486. doi:10.1038/383732a0. 
  61. ↑ Kiss-László Z và đồng nghiệp (tháng 6 năm 1996). “Site-specific ribose methylation of preribosomal RNA: a novel function for small nucleolar RNAs”. Cell 85 (7): 1077–88. PMID 8674114. doi:10.1016/S0092-8674(00)81308-2. 
  62. ↑ Daròs JA, Elena SF, Flores R (tháng 6 năm 2006). “Viroids: an Ariadne's thread into the RNA labyrinth”. EMBO Reports 7 (6): 593–8. PMC 1479586. PMID 16741503. doi:10.1038/sj.embor.7400706. 
  63. ↑ Kalendar R và đồng nghiệp (tháng 3 năm 2004). “Large retrotransposon derivatives: abundant, conserved but nonautonomous retroelements of barley and related genomes”. Genetics 166 (3): 1437–50. PMC 1470764. PMID 15082561. doi:10.1534/genetics.166.3.1437. 
  64. ↑ Podlevsky JD và đồng nghiệp (tháng 1 năm 2008). “The telomerase database”. Nucleic Acids Research 36 (Database issue): D339–43. PMC 2238860. PMID 18073191. doi:10.1093/nar/gkm700. 
  65. ↑ Blevins T và đồng nghiệp (2006). “Four plant Dicers mediate viral small RNA biogenesis and DNA virus induced silencing”. Nucleic Acids Research 34 (21): 6233–46. PMC 1669714. PMID 17090584. doi:10.1093/nar/gkl886. 
  66. ↑ Jana S và đồng nghiệp (tháng 11 năm 2004). “RNA interference: potential therapeutic targets”. Applied Microbiology and Biotechnology 65 (6): 649–57. PMID 15372214. doi:10.1007/s00253-004-1732-1. 
  67. ↑ Schultz U, Kaspers B, Staeheli P (tháng 5 năm 2004). “The interferon system of non-mammalian vertebrates”. Developmental and Comparative Immunology 28 (5): 499–508. PMID 15062646. doi:10.1016/j.dci.2003.09.009. 
  68. ↑ Whitehead KA và đồng nghiệp (2011). “Silencing or stimulation? siRNA delivery and the immune system”. Annual Review of Chemical and Biomolecular Engineering 2: 77–96. PMID 22432611. doi:10.1146/annurev-chembioeng-061010-114133. 
  69. ↑ Dahm R (tháng 2 năm 2005). “Friedrich Miescher and the discovery of DNA”. Developmental Biology 278 (2): 274–88. PMID 15680349. doi:10.1016/j.ydbio.2004.11.028. 
  70. ↑ Caspersson T, Schultz J (1939). “Pentose nucleotides in the cytoplasm of growing tissues”. Nature 143 (3623): 602–3. Bibcode:1939Natur.143..602C. doi:10.1038/143602c0. 
  71. ↑ Ochoa S (1959). “Enzymatic synthesis of ribonucleic acid” (PDF). Nobel Lecture. 
  72. ↑ Rich A, Davies D (1956). “A New Two-Stranded Helical Structure: Polyadenylic Acid and Polyuridylic Acid”. Journal of the American Chemical Society 78 (14): 3548–3549. doi:10.1021/ja01595a086. 
  73. ↑ Holley RW và đồng nghiệp (tháng 3 năm 1965). “Structure of a ribonucleic acid”. Science 147 (3664): 1462–5. Bibcode:1965Sci...147.1462H. PMID 14263761. doi:10.1126/science.147.3664.1462.  Bảo trì CS1: display-authors (link)
  74. ↑ Fiers W và đồng nghiệp (tháng 4 năm 1976). “Complete nucleotide sequence of bacteriophage MS2 RNA: primary and secondary structure of the replicase gene”. Nature 260 (5551): 500–7. Bibcode:1976Natur.260..500F. PMID 1264203. doi:10.1038/260500a0.  Bảo trì CS1: display-authors (link)
  75. ↑ Napoli C, Lemieux C, Jorgensen R (tháng 4 năm 1990). “Introduction of a Chimeric Chalcone Synthase Gene into Petunia Results in Reversible Co-Suppression of Homologous Genes in trans”. The Plant Cell 2 (4): 279–289. PMC 159885. PMID 12354959. doi:10.1105/tpc.2.4.279. 
  76. ↑ Dafny-Yelin M và đồng nghiệp (tháng 12 năm 2007). “pSAT RNA interference vectors: a modular series for multiple gene down-regulation in plants”. Plant Physiology 145 (4): 1272–81. PMC 2151715. PMID 17766396. doi:10.1104/pp.107.106062. 
  77. ↑ Ruvkun G (tháng 10 năm 2001). “Molecular biology. Glimpses of a tiny RNA world”. Science 294 (5543): 797–9. PMID 11679654. doi:10.1126/science.1066315. 
  78. ↑ Fichou Y, Férec C (tháng 12 năm 2006). “The potential of oligonucleotides for therapeutic applications”. Trends in Biotechnology 24 (12): 563–70. PMID 17045686. doi:10.1016/j.tibtech.2006.10.003. 
  79. ↑ Siebert S (2006). “Common sequence structure properties and stable regions in RNA secondary structures” (PDF). Dissertation, Albert-Ludwigs-Universität, Freiburg im Breisgau. tr. 1. Bản gốc lưu trữ ngày 9 tháng 3 năm 2012. 
  80. ↑ Szathmáry E (tháng 6 năm 1999). “The origin of the genetic code: amino acids as cofactors in an RNA world”. Trends in Genetics 15 (6): 223–9. PMID 10354582. doi:10.1016/S0168-9525(99)01730-8. 
  81. ↑ Marlaire R (3 tháng 3 năm 2015). “NASA Ames Reproduces the Building Blocks of Life in Laboratory”. NASA. Truy cập ngày 5 tháng 3 năm 2015. 

Tài liệu tham khảo

WikiPedia: RNA http://www.biomedcentral.com/1471-2164/14/325 http://www.nature.com/embor/journal/v2/n11/full/em... http://adsabs.harvard.edu/abs/1939Natur.143..602C http://adsabs.harvard.edu/abs/1965Sci...147.1462H http://adsabs.harvard.edu/abs/1976Natur.260..500F http://adsabs.harvard.edu/abs/1993PNAS...90.6498S http://adsabs.harvard.edu/abs/1996Natur.383..732C http://adsabs.harvard.edu/abs/1999PNAS...96.6841H http://adsabs.harvard.edu/abs/2000Sci...289..920N http://adsabs.harvard.edu/abs/2002Sci...296.1260S